《国有土地上房屋征收与拆迁补偿条例》将会适用于农村吗?

应当按照法律的规定进行。
                        

《房屋征收补偿条例意见稿中五大问题存争议》一文就知道了，中国人民大学法学院副院长王轶对“法律阳光何时照耀农村集体土地上的房屋征收”是这样回答的：王轶认为，依据我国《立法法》的规定，对于非国有财产的征收，应当由法律规定；对于农村集体土地的征收问题，不属于国务院制定行政法规的立法权限，而且新条例的依据是《全国人民代表大会常务委员会关于修改〈中华人民共和国城市房地产管理法〉的决定》，决定只是授权国务院就征收国有土地上单位、个人的房屋与拆迁补偿制定行政法规，因此目前的征求意见稿无法涵盖这部分内容。    这些严重的官僚主义,现在自由市场都有人管,而农村集体土地却不属于国务院制定行政法规的立法权限,难道国务院没有制定行政法规的立法权限,农村集体土地就没有人管了吗?   目前，全国各大中城市的城市化建设已推进了几年，拆迁改造已经从市区向市郊发展，多数城市的拆迁改造中，集体土地上房屋“农村房”已经占了拆迁改造的大多数，而即将出台的房屋征收与补偿条例确没有包含集体土地上房屋，适用范围太小，使得城市化建设中对集体土地上房屋的拆迁改造仍无法可依。